?深海栖舰
游戏中的主要敌人。在官方出版的作品中，据说是被击沉的舰船的怨灵，由于怨气无法消失而形成反抗人类势力的暗黑生物。深海栖舰的等级或排水量越高，越接近于人形。有些关卡中会出现红色的精英级（elite）栖舰和金色的旗舰级（flagship）栖舰。在2014年3月14日更新之后，出现了围绕金色光芒，左眼放出蓝色火焰的旗舰改级（flagship改）。普通深海栖舰的舰级命名是按先后顺序以伊吕波歌命名的。
最强Boss之一——战舰栖姬
驱逐舰：驱逐イ级、驱逐ロ级、驱逐ハ级、驱逐二级
轻巡洋舰：轻巡ホ级、轻巡ヘ级、轻巡ト级、轻巡ッ级
重雷装巡洋舰：雷巡チ级
重巡洋舰：重巡リ级、重巡ネ级
战舰：战舰ル级、战舰タ级、战舰レ级
航空战舰：战舰レ级
轻空母：轻母ヌ级
正规空母：空母ヲ级
输送船：输送ワ级
潜艇：潜艇カ级、潜艇ヨ级、潜艇ソ级
浮炮台：浮游要塞、护卫要塞
鬼姬型深海栖舰：
《舰Colle》中，具有鬼、姬、战鬼、战姬为铭牌的深海栖舰为深海栖舰的上位个体，具有超乎普通深海栖舰的能力。分为海基型与陆基型，海基型与普通深海栖舰相似，陆基型则免疫一切雷击，但三式弹可对其造成2.5倍的伤害。
除了装甲空母鬼与装甲空母姬之外的鬼姬型深海栖舰具有CV配音。
陆基型：港湾栖姬、飞行场姬、离岛栖鬼、北方栖姬、中间栖姬
驱逐舰：驱逐栖姬
轻巡洋舰：轻巡栖鬼
正规空母：空母栖鬼、空母栖姬、空母水鬼
航空战舰：泊地栖鬼、泊地栖姬、装甲空母鬼、装甲空母姬、南方栖鬼、南方栖战鬼、南方栖战姬
战舰：战舰栖姬、战舰水鬼;