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蒙古军的杀戮还在继续，所到之处全是摧毁性的景象。
呼罗珊的每一寸土地，每天都在流血和呻吟。巴里黑被屠城之后，拖雷的军队围攻马鲁，这座城市在这一年内被屠杀了两次，大约一百多万人被杀死。而在另一大城你沙不儿，由于铁木真第四女的丈夫不幸被射杀，等待这个城市只有毁灭，城破时，铁木真第四女带领她的手下入城，将活人全部杀死，城内连一条猫狗也不能留下。拖雷听说在屠杀马鲁时，有些人藏在尸体中逃脱了，于是他命令割下每个死者的脑袋，并将男人、女人与小孩的头分开，堆成三座人头塔。你沙不儿的这种大屠杀，共进行了十五天。只有在也里城，因为投降的早，除了官吏与士兵，居民得以保存性命。
总之，在1221年春夏的几个月之内，铁木真、拖雷父子将呼罗珊变成了一个修罗场。
然而，蒙古军征伐的对象，并非全是懦弱之辈，英勇的新算端札兰丁和他的追随者帖木儿－灭里，在逃离玉龙赤杰之后，在经过奈撒时，击溃了一支驻守该地的蒙古军，取得了抗击蒙古入侵的首次胜利，这为札兰丁赢得了不少力量的投奔。
在塔里寒山区（今阿富汗巴达克山省塔利罕县），铁木真在自己的行营之中来回踱着步子，在这里，他的中军遇到了一个难啃的硬骨头，该地的城堡除了坚固之外，还有一大批准备获取自己功名的勇士，守军的顽强抵抗，让他的中军受到了很大的损失。
铁木真的三位儿子在攻打玉龙赤杰受到了更大的挫折。札兰丁逃出之后，群龙无首的玉龙赤杰将领、贵族们，在没有办法的情况下，根据民族传统集体推举摩诃末母亲的亲戚忽马儿为“假算端”，又称为“诺鲁思王”即“一日之王”，由忽马儿临时摄政，希望他能在敌军来袭时能带领大家渡过难关。玉龙赤杰是一座跨越乌浒河两岸的城市，中间有桥相接，作为都城，它是一座经营已久易守难攻的城池，蒙古军去年秋天起，围攻了七个月却让蒙古军死伤惨重。
但是一个来自玉龙赤杰的密使，将蒙古军损失惨重的原因如实禀报给了铁木真，让铁木真极其愤怒。因为其中一个重要原因，就是术赤与察合台两人不和，两人相互拆台，对对方指手画脚，让下属不知所措。玉龙赤杰属于术赤的封地，察合台认为自己是在替术赤卖命。而窝阔台却因为是弟弟，虽是储君，但因未得到成吉思汗的授权而无法插上话，更是因为他不想将两位兄长都得罪了，甚至他有渔翁得利的心思。
这当然不是成吉思汗所希望知道的局面。
“大战当前，他们居然为了斗气而让军队不知所措，白白耗费我蒙古儿郎的性命，此等事情，他们居然能做得出来，忘了我跟他们说过的话。”铁木真怒气冲天地骂道，“术赤与察合台不是曾说过要相互扶持吗？我怎么会有这样的儿子呢？他们的眼里还有没有我这个父亲！”
“大汗息怒，玉龙赤杰本就是一个坚固的大城，城内守军又人数众多，还有随时可以填补的兵源，三位殿下不能攻下，也是很正常的事情。”纳牙阿劝慰道。
“很不幸啊，又被不儿罕言中了，术赤、察合台和窝阔台三人一起出征，没有一个人领头看来是不行。纳牙阿，你说该怎么办？”铁木真道。
“大汗不如派遣一使者，携一面虎头金牌，让窝阔台殿下全权负责所有的大事。”纳牙阿奏道，“如此，全军就有了主心骨，有了您的旨意，窝阔台殿下也就能放开手脚。”
“看来也只有如此了！”铁木真无奈地回答道，又忽然问道，“纳牙阿，你说不儿罕这个少年人为何就能预卜到呢？难道他真地得到了长生天的启示？”
“大汗，有关神灵的事情，末将不敢揣测，不过，他若不是得到长生天的庇护，怎会一次又一次让末将胆战心惊呢？”纳牙阿奏道。
铁木真低头深思了一番，才说道：“神灵的事情，总是让人难以预测，我身为合罕，也不能违抗长生天的旨意。”
“大汗英明！”纳牙阿道。只是他心中有了个很大的疑问：成吉思汗口中的旨意到底是什么。
“不儿罕最近在干什么？不是还在搜刮那些唯利是图的商人们的钱财吧？”铁木真问道。
“禀大汗，春天时，听说他正忙着安顿逃去撒马儿干的流民。”纳牙阿道，“发放种子和耕牛，让那些逃去的人耕种。”
“哦，他是个很有才能很有见识的人，就是心肠太软，这样哪里能办得了大事。看来，他将来就是个做宰相的好人选。”铁木真道。
“大汗所言极是，依我看，不儿罕恐怕是天底下最聪明的人，难得的是他没有私心，从商人身上所得全都入帐，如实地送到您的面前。”纳牙阿道，“不过，我听说，我大军大部征战在外，沙漠中的强盗也猖狂了起来，已经截杀了不少商队。不儿罕刚派人来请求大汗派出一支军队剿灭这些盗匪，因为如果那些商队若是不敢来，赋税恐怕就少收了不少。”